1 系統(tǒng)的組成和工作原理
本系統(tǒng)由基本PCR部分、熒光檢測部分和上位計算機部分等組成。
基本PCR部分是該儀器的基礎,包括加熱絲、溫度采集與處理等部分,它必須具有控溫、快速升降溫、溫度場均一等PCR儀的基本要求,保證PCR過程的順利完成。
熒光檢測部分包括激勵光源、光電倍增管、信號采集與處理等部分。
上位計算機部分包括數(shù)據(jù)采集和系統(tǒng)分析軟件,主要負責從下位機采集數(shù)據(jù),形成實時圖形,并進行數(shù)據(jù)處理和圖形分析,得到目標DNA片段的含量和其它檢測報告信息等。
工作時,主計算機首先投入運行,同時工作人員把所測樣品放入PCR反映腔體的樣品架上,工作人員根據(jù)所測樣品的PCR反應條件設置相應的溫度參數(shù)、控溫時間以及循環(huán)次數(shù)等,接著工作人員點擊相應的按鈕控件,系統(tǒng)就進入快速升溫、恒溫、快速降溫、恒溫等PCR循環(huán)過程,直至所有的循環(huán)結柬,同時在每一循環(huán)的低溫段恒溫結柬前系統(tǒng)進行樣品的熒光信號實時采集,主計算機根據(jù)采集到的信號形成實時圖形,并進行數(shù)據(jù)處理和圖形分析,得到目標DNA片段的含量和其它檢測報告信息等。
2 系統(tǒng)的硬件設計
系統(tǒng)的硬件主要由溫度信號采集處理部分、熒光信號采集處理部分、單片微機控制系統(tǒng)部分、驅動電路部分以及計算機系統(tǒng)等組成。
2.1 溫度信號采集處理部分
這一部分包括溫度傳感器、傳感器接口電路以及信號放大電路,在這里溫度傳感器采用熱電偶,由于熱電偶通過微小電壓進行溫度測量,容易受干擾,在具體的設計中,干擾問題往往很難一下拿出明確的解決方案,要根據(jù)干擾的種類找原因,對癥下藥。在本設計中,主要采取了以下的抗干擾措施,Roche_Light Cycler 480II熒光定量PCR儀保證溫度采集的準確性:(1)在熱電偶的輸出端追加濾波電容;(2)加變送器,利用熱電偶的接口芯片,把溫度信號直接轉換成電壓信號,這個信號不易受干擾。
2.2 熒光信號采集處理部分
熒光信號采集處理部分主要包括光檢測系統(tǒng)和信號采樣處理系統(tǒng)兩部分。
2.2.1 光檢測系統(tǒng)
光檢測系統(tǒng)主要包括光源(待測樣品)、濾光片、光電倍增管以及敏感度選擇電路等。微處理器在檢測過程中,按光檢測值大小動態(tài)調整電位器輸出,改變光電倍增管控制電壓板的電壓輸入,自動調整光電倍增管測量靈敏度。
光電倍增管采用H5783型倍增管,它具有如下特性:
(1)結構上將倍增管、電磁屏蔽筒、高低壓供電單元、電壓控制單元全部集成在一起,使用方便;(2)光譜靈敏度高,暗電流小;(3)可根據(jù)測量光信號強度的不同,通過程序調節(jié)控制電壓,自動調整測量系統(tǒng)的靈敏度。
2.2.2 信號采樣處理電路
光電倍增管輸出的電流信號可作為恒流源,將運算放大器作為負載電阻實現(xiàn)電流電壓的轉換, 信號處理電路,其輸出電壓U0=一gf~xf,式中gf為運算放大器的反饋電阻,反饋電阻Rf值的選擇要按光電倍增管陽極的大輸出電流、A/D采樣輸入滿量程值、運算放大器的開環(huán)增益等來確定,同時還要考慮保證系統(tǒng)的高頻特性。
輸出電路的小可測量電流受到運算放大器的偏置電流、溫飄、反饋電阻特性以及電路板的絕緣性能的影響。
2.3 單片微機控制系統(tǒng)
這一部分主要負責溫度的采集、溫度的控制、熒光信號的采集以及對光電倍增管控制極電壓的調整、外圍執(zhí)行機構的驅動控制以及與上位計算機的實時通訊等。主要由微處理器、A/D轉換芯片、通信接口芯片等組成。在該系統(tǒng)中,微處理器采用P89C51微處理器。該芯片具有并行可編程的非易失性FLASH程序存儲器。是80C51的派生器件,指令系統(tǒng)與80C51*相同,其主要特性為:
(1)速度可達32M;(2)片內FLASH程序存儲器,可在線編程;(3)RAM 可擴展到65K字節(jié);(4)全雙工增強型UART~(5)4個8位I/O 口;(6)6個中斷源。上述特性可實現(xiàn)本系統(tǒng)所要求的實時檢測處理、控制、通訊等功能。
A/D轉換芯片采用AD674,該芯片是美國模擬器件公司(Analog Devices)生產的12位逐次逼近快速A/D轉換器。
片內配有三態(tài)輸出緩沖電路,可直接與各種典型的8位或16位微處理器相連,而無須附加邏輯接口電路,且能與CMOS及1vrL電平兼容,并且片內含有高精度的參考電壓源和時鐘電路,這使它在不需要任何外部電路和時鐘信號的情況下完成一切A/D轉換功能,應用非常方便。為了保證A/D采樣的準確性模擬信號輸入端可加采保器LF398。要注意的一點是與P89C51單片機接口電路設計時。單片機的時鐘一定要接12M及以上,防止因AD674數(shù)據(jù)總線傳輸速度快而造成時序不匹配。
2.4 驅動電路部分
考慮到風門電機、磁吸開關、轉盤電機、加熱風扇等外圍執(zhí)行設施較多,而且要分別單獨供電,同時,為了克服上述外設對微計算機系統(tǒng)可能造成的干擾,就把這一部分單獨做成一塊驅動板,Roche_Light Cycler 480II熒光定量PCR儀由單片機系統(tǒng)I/O擴展口直接驅動光電耦合器件,經光電耦合器件的輸出端再加電流放大驅動。